Они готовы к такому развитию событий, и у них есть план, как помешать Шреддеру осуществить задуманное. Да-да, это снова он, давний противник наших героев. Шреддер вступил в сговор с Крэнгом, существом из Измерения Икс. Этот сверхмозг в теле огромного андроида открыл портал над городом, и теперь его передвижная крепость Технодром контролирует воздушное пространство.
С помощью Эйприл О’Нил черепашки узнают, что Клан Фут и его предводитель наведались в лабораторию к безумному ученому Бакстеру Стокману, где с помощью усовершенствованного мутагена создали двух супермутантов – Рокстеди и Бибопа. Эта парочка сильно усложняет задачу для Леонардо и его братьев, но неожиданно, в их команде происходит пополнение - герой-одиночка Кейси Джонс готов сражаться плечом к плечу с черепашками против новой угрозы.
Осталось только подкрепиться пиццей, и в бой!